2015年12月，发表于《Gut》的一项研究考察了质子泵抑制剂对肠道微生物的影响。结果显示，PPI使用者肠道感染风险增加。

背景和目的：质子泵抑制剂（PPIs）是世界最广泛使用的十大药物之一。PPI使用与肠感染风险增加相关，最常见的是艰难梭菌。肠道微生物在肠道感染中起着重要作用，抑制或促进病原体定殖。本研究中，我们调查了PPI使用对肠道微生物的影响。

方法：3个队列中，肠道微生物共有1815个，采用16S rRNA基因的标记测序进行评估。在每个队列中，分别分析PPI使用者和未使用者的微生物组成差异，随后进行荟萃分析。

结果：211名受试者的粪便样本显示使用PPIs。PPI使用与微生物多样性的显著降低和20%细菌分类变化相关（错误发现率＜0.05）。PPI使用者的粪便微生物中大多数是多种口腔细菌，包括罗氏菌属（p=9.8×10−38）。在PPI使用者中，我们观察到显著增加的细菌有：肠球菌，链球菌，葡萄球菌和潜在致病的大肠杆菌。

结论：本研究观察到PPI使用者和未使用者之间的差异与少量健康肠道微生物的不断变化相关。这些差异与已知可能引起艰难梭菌感染的变化是一致的，并可以解释PPI使用者中肠道感染风险的增加。在一个人群水平，PPI的作用比抗生素或其他常用药物的作用更突出。