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胰腺癌的基因和靶向治疗
作者:台州质控 时间:2015-10-19 点击:656 来源:浙江省医院药事管理质控中心网
 

NCI SEER 的数据显示胰腺癌 5 年生存只有 5-6%,大多数患者诊断时都已是进展期,区域性和远处转移分别为 27% 53%。胰腺癌治疗方面最近也没有突破性进展,含吉西他滨的治疗和手术是近 10 余年来的标准治疗,无论是用作新辅助还是辅助化疗,化疗选择很有限。美国 Frank 博士在 Canlet 杂志上介绍了个体化基因组医学在胰腺癌治疗上的应用。

人类基因组计划(HGP)自 1990 年启动,于 2003 年提前完成,鉴定了大约 30 亿碱基对和大约 24,500 基因,但是直至 2007 年通过 Sanger 测序技术才完成人类基因测序。1 年后科学家采用快速测序 454 技术检测基因组,花费仅为传统测序费用的百分之一,历时 2 个月完成。新的测序技术和巨大的数据信息,促进「个体化基因组医学」的发展。

个体化基因组医学采用基因组信息提高诊断、指导分子和基因治疗选择,医师通过检查高危患者癌症相关基因变化,如高危患乳腺癌患者检查 BRCA 基因,来指导诊断与治疗。现代技术允许直接芯片分析唾液标本中的 DNA,该技术核心是单核苷酸多态性(SNPs)。SNPs 约占全 DNA 变化的 90%,与免疫组化联合有助于鉴定恶性疾病中蛋白表达与功能异常,特别适合用胰腺癌。

胰腺癌异质性很强,遗传学标志包括全基因组不稳定性,如突变、易位和插入 / 缺失、非整倍体。全基因组分析显示,12 个核心信号途径皆有遗传学变化。最常见遗传学改变包括 DNA 复制,KRASTGF-β、凋亡和细胞周期途径改变。引起林奇综合征的 MMR 突变,引起遗传性乳腺 - 卵巢癌的 BRCA 突变,在胰腺癌特别是家族性胰腺癌中约占 5–10%

胰腺肿瘤的遗传学改变能使得医师明确:(1)肿瘤对化疗、放疗或是手术的治疗反应;(2)细化治疗,如新辅助、辅助和基因治疗;(3)有效的药物使用方法。这些信息在临床上很重要,可以增加疗效、降低毒性、改善患者的生活质量。胰腺癌非常容易出现多药耐药,通过基因组学信息可以获得优化治疗的相关信息,还可以预测预后、减少不必要的治疗。

胰腺癌标本可以通过如下手段获取:手术活检、内镜超声指引的细针抽吸(EUS-FNA)或循环中的肿瘤细胞(CTCs)。手术切除胰腺癌仍是活检金标准,而侵袭性较小的方法如 EUS-FNA 正在推广。但是 FNA 抽吸细胞难于在良性胰腺疾病中鉴别恶性损害,如慢性胰腺炎具有胰腺癌的细胞形态特征。

CTCs
来自原发或转移位置的肿瘤,可以由外周血分离获得,是潜在的胰腺癌标志。最近采用深度测序血清标本中 KRAS 突变情况,Yu 等建立了方便快速的方法检查 KRAS 突变,敏感性 87.5%,精确性 92.9%,当肿瘤标本无法获得时这可能是特别有价值的一种检测方法,因为要改善胰腺癌诊断或早期诊断需要新的分子或遗传学标志。

胰腺癌的基因组学 

对胰腺癌进展和其遗传学改变之间的关联已有很深刻的认识。2008 24 例胰腺癌全外显子组测序显示,平均 63 个基因改变,多为点突变,KRASCDKN2ATP53 SMAD4 基因突变最常见。Biankin 142 I II 期术前胰腺癌基因组测序,鉴定了 16 个明显的突变基因,包括 ATM MLL3。其它报告的基因有 BRCA1PDX-1 SLC39A4。胰腺癌中关键基因总结见表 1

1 胰腺癌的基因组学 

KRAS 突变存在于 90% 以上的侵袭性胰腺癌,与胰腺上皮内肿瘤(PanINs)进展为胰腺癌有关。KRAS 是原癌基因,一旦有点突变活化,就能招募活化生长因子和受体信号,发生恶性转化;EGFR 具有促进肿瘤细胞生长的作用,是 KRAS 的上游基因。

结肠癌中如果 KRAS 活化,则靶向 EGFR 的药物无效,所以抗 EGFR 治疗之前进行遗传学检查十分必要。通过粪便标本和实时甲基化特异性多聚酶链反应(MSP)检测 KRAS 可能会成为胰腺癌的一种检测方法。此外血浆 DNA 测序可能为理解癌症发生、早期诊断提供新的认识,EUS-FNA 允许医师活检胰腺癌以进一步对 KRAS 测序。

PanINs 发展到胰腺癌的过程中,CDKN2A基因的缺失可以导致肿瘤抑制基因 P16 表达下调,在 86-95% 的散发胰腺癌中 P16 功能缺失发生在疾病早期。免疫组化显示淋巴侵犯和缺少 P16 表达之间存在明显的关联性。P16 能抑制细胞增殖,突变后参与多肿人类癌症的发生发展。

P53
PanINs 发展到胰腺癌的过程中也经常发生突变,它参与细胞周期捕获、活化 DNA、启动凋亡等过程。SMAD4/DPC4 肿瘤抑制基因是晚发事件,它参与 TGF-β介导的细胞生长调节,其缺失经常发生于转移性疾病,降低总生存(OS)。

BRCA1/2
PanINs 发展到胰腺癌过程中的晚期事件,它参与 DNA 修复。体外数据显示 BRCA2 有缺陷的人类胰腺癌细胞株对 DNA 损害高敏感,如 PARP 抑制剂。PARP 家族,特别是 PARP1 2 DNA 单链修复密切相关,所以 PARP 抑制剂对 BRCA1/2 有缺陷的细胞有杀伤作用。

PDX1
控制胰腺的胚胎期发育,存在于正常成熟胰腺的β细胞中,在部分胰腺切除后和胰腺炎时 PDX1 可在导管细胞内重新表达,大约 90% 胰腺癌是导管腺癌,所以胰腺癌干细胞可能位于胰腺导管并表达 PDX1,在恶性转化中发挥作用。PDX1 主要在肿瘤浸润边缘和转移淋巴结中表达,与 TNM 分级、细胞增殖和降低生存有关。

ZIP4
是新的胰腺癌分子标志,它可以将锌转运入细胞,而 ZNT 家族则可将锌导出细胞。锌是许多酶的辅助因子,对高代谢和快速分裂的细胞很重要,如癌细胞。ZIP4 在大多数胰腺肿瘤中过度表达,可能与胰腺肿瘤进展相关。小鼠模型显示 ZIP4 沉默降低肿瘤生长,过度表达促进肿瘤生长和转移。

42 例胰腺癌组织采用 Sanger 测序,发现了 ZIP4 的变化,并鉴定了几处 SLC39A4 SNP,部分 SNP 位于蛋白异构体 1 的启动子区域,可能会改变 ZIP4 表达。另只有一例胰腺癌组织存在蛋白异构体 1 密码子 459 和蛋白异构体 2 密码子 484 错义突变,由于发生频度低,可能是背景突变,还有几例肿瘤组织存在杂合性缺失(LOH)。

ZIP4
基因的错义片段可能会降低细胞对负性调节的反应,但需要功能分析证实这一假说;每个 SNP 也都需要进一步研究,确立其与蛋白功能的相关性。上述结果表明 SLC39A4 在胰腺肿瘤中突变并不明显,ZIP4 野生型的过度表达可能有助于胰腺癌生长。

EUS-FNA
对评估胰腺癌是一项非常有前景的技术,这种技术侵袭性小,无需浪费大量资源,为遗传学和免疫组化检测提供标本。胰腺癌突变发生很快,迅速产生治疗拮抗,而 EUS-FNA 可以实时提供标本进行遗传学改变研究。联合 FNA 和遗传学检查可能会成为早期检测胰腺癌、优化治疗的有前景的方法。

胰腺癌的药物基因组学 

遗传学影响药物治疗的相关知识有助于改善个体化治疗的有效性。1997 年吉西他滨作为标准治疗,同 5- 氟脲嘧啶相比,可以改善疼痛控制和 OS。吉西他滨是胞嘧啶的类似物和前药,在体内转化为活性代谢物,阻止 DNA 合成,但这种相互作用却可以因为 RECQL 基因的多态性而被打断,RECQL 基因编码 DNA 解螺旋酶,

吉西他滨进行活化代谢时必需穿过细胞膜并磷酸化,这个过程由 hENT hCNT 核苷酸转运子完成。胰腺导管腺癌吉西他滨治疗后采用免疫组化方法检查,具有可检测和不可检测的 hENT1 者,中位生存时间分别为 13 个月和 4 个月,而且 hENT1 蛋白表达与辅助性吉西他滨治疗患者的 OS 和无病生存明显相关。

低水平 hENT1 的患者可能不会获益于吉西他滨治疗,但是吉西他滨 5′- 反式油酸,也称作 CO-1.01,可能是例外,该药是吉西他滨的脂肪酸衍生物,不需要 hENT1 转运其通过细胞膜。一项 II 期试验比较低表达 hENT1 患者对吉西他滨与 CO-1.01 的治疗反应,研究正在进行中。

明确胰腺癌患者 hENT1 基因序列在临床上很有意义,因为一些亚组患者可能对吉西他滨更敏感,只要较低剂量治疗即可。鉴定 hENT1 启动子或外显子区域的突变可能会明确 hENT1 蛋白表达水平或功能状态的变化,并据此调整药物治疗剂量。CO-1.01 可以作为治疗的另一种选择。

吉西他滨的代谢能影响其治疗有效性,脱氧胞嘧啶激酶 (DCK) 和胞嘧啶核苷脱氨酶 (CDA) 影响治疗有效性,因为 DCK 使吉西他滨磷酸化为活性形式,CDA 则将吉西他滨代谢为无活性形式。

研究发现 DCK 低和高的胰腺癌患者 OS 分别为 14.6 21.7 个月,但 DCK 低者较高者至少年长 10 岁,说明年龄相关甲基化和表观因素可能会影响 DCK 水平。对人类胰腺癌细胞株评估,发现 DCK AG 基因型对吉西他滨敏感性超过 GG 基因型,说明 SNP 可以预测吉西他滨有效性。一项 CDA 研究发现患者具有纯合 CDA*3 CDA 活性特别低,吉西他滨治疗产生严重毒性。

FOLFIRINOX
联合 5-FU、伊立替康、亚叶酸和奥沙利铂是胰腺癌治疗的一大进展,同单药吉西他滨相比,增加 IV 期疾病 OS 4.3 个月,但同时毒性也明显增加。FOLFIRINOX 方案中包含 5-FU5-FU 的代谢机制可能会影响个体化治疗。

二氢嘧啶脱氢酶(DPD)是负责 5-FU 代谢的关键酶,一项研究中包括 II 期及以上胰腺癌,研究 DPD 表达与 5-FU 肝脏灌注化疗间的关系及 OS,结果显示术后 5-FU 治疗患者,DPD 水平低者较高者有生存获益。另有研究纳入 171 例患者,二处 DPD SNPsIVS14+1 G>A 2946 A>T 5-FU 早期治疗毒性明显相关。总之基因组检查可预测毒性、确定精准的有效化疗剂量。

药物运输的药物基因组学 

胰腺肿瘤药物输送屏障包括过多的纤维组织和致密的基质,后者主要由分泌的酸性蛋白和富于半胱氨酸(SPARC)造成,SPARC 有多种功能,包括促进伤口愈合;通过调节基质沉积和转换、细胞粘附以及细胞外信号来介导细胞和微环境间的相互作用;还可抑制血管生成,参与上皮 - 间充质转化(EMT),诱导形态学变化丢失粘附特性。

SPARC
在胰腺癌细胞株中可能是肿瘤抑制基因,因为 shRNA 抑制内源性 SPARC 能促进细胞生长,外源性 SPARC 抑制细胞生长和迁移。邻近原发胰腺肿瘤的基质纤维细胞表达高水平 SPARC,可能参与结缔组织形成、降低血管密度和细胞侵袭。SPARC 在邻近纤维细胞的表达通过肿瘤 - 基质相互作用调节,也可能通过旁分泌调节,可能是为了控制侵袭性肿瘤生长而作出的反应。

探索 SPARC 在胰腺癌中的作用可能会改善胰腺癌治疗模式。从正常组织到慢性胰腺炎组织,到非恶性组织,直至胰腺癌,SPARC 基因甲基化(TRR)程度持续增高,已发现二个相对过度甲基化波峰,CpG 区域 1 CpG 区域 2

正常胰腺中 CpG 区域 1 经常甲基化,而 CpG 区域 2 则极少甲基化,但在邻近胰腺癌的非恶性组织中 CpG 区域 2 的甲基化水平明显高于正常胰腺组织,而且高 CpG 区域 2 甲基化与大肿瘤、烟草、饮酒、慢性胰腺炎相关,所以有可能成为早期诊断胰腺肿瘤的标志。

另一个 SPARC 的检测方法是 FNA 活检,进行组织 mRNA 分析,这个方法很重要,因为不是所有的 FNA 标本都足够大、适合免疫组化检查。有研究发现 SPARC mRNA 高水平表达是明显的胰腺癌独立预后标志,低水平 SPARC mRNA 的胰腺癌 5 年生存率为 20.24%,而高水平 SPARC mRNA 的患者 5 年生存率为 0

以往的研究探讨了 SPARC 在运输药物中的作用,并比较了白蛋白紫杉醇联合吉西他滨与单药吉西他滨的疗效,结果显示白蛋白紫杉醇能增加肿瘤内吉西他滨的浓度,减少肿瘤周围纤维间质,这意味着白蛋白紫杉醇可能靶向基质 SPARC 并允许化疗药物运输进入肿瘤。SPARC 对胰腺癌的作用仍不清楚,需要进一步研究其靶向胰腺癌治疗的潜能。

抑制 SPARC 表达可能会阻止胰腺癌通过 p53 诱导的核蛋白 1TP53INP1)进行的侵袭,TP53INP1 能上调 p53 并在体外减低细胞迁移。胰腺癌中它的表达缺失,而恢复表达后则可抑制胰腺肿瘤发展,胰腺癌细胞显示 TP53INP1 表达缺失者具有高度转移性。

正常胰腺中 miR-155 很低,允许 TP53INP1 抑制 SPARC 表达,并减少细胞迁移。在 PanIN l 损害中,高水平 miR-155 能下调 TP53INP1 并上调 SPARC,增加细胞迁移。胰腺癌中 miR-155 水平很高,TP53INP1 完全阻滞,同时 SPARC 启动子过度甲基化,但胰腺癌细胞迁移能力仍有增加,是因为基质细胞过表达 SPARC

其它与胰腺癌有关的几个基因如 SLC39A4 PDX1 等,有促进胰腺癌生长的作用。胰腺癌中 ZIP4 在复杂的信号网络中发挥作用,如 miRNAs、细胞因子和锌依赖转录因子,小鼠胰腺癌模型中通过 RNA 干扰下调 ZIP4 发挥肿瘤抑制作用,靶向这些下游效应子的治疗可能会成为新的有效治疗胰腺癌的方法。

PDX1
也显示出治疗胰腺癌、胰岛瘤和胰岛恶性肿瘤的作用。特殊设计的 RNA 干扰效应子平台,是具有生物功能的 shRNAPDX-1 脂质体复合物,能迅速降低小鼠胰腺癌异种移植模型的肿瘤容积、增加生存。需要进一步明确,根据胰腺癌中 ZIP4 PDX-1 的改变进行的靶向治疗的安全性和有效性。

总结 

基因组测序具有改善胰腺癌诊断与治疗的巨大潜能。近期遗传学研究明确了一些胰腺癌新的标志和治疗靶点,但是现有检查方法实践性不强。由于胰腺癌远期预后差,鉴定其遗传学改变的需求非常迫切,发现新的胰腺癌遗传学改变对改善胰腺癌的诊断、药物剂量的精确性及发现新的治疗手段非常有帮助。

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